Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFX1Q12986 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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