Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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