Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRIM25Q14258 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM25Q14258 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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