Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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