Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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