Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms