Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNB1Q02641 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms