Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXQ1Q9C009 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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