Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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