Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC61Q9Y6R9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms