Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPN6Q9Y6Q1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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