Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP3Q9Y6F1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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