Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms