Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX9Q9Y5X1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms