Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2APQ9Y5K6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD2APQ9Y5K6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms