Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms