Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KNSTRNQ9Y448 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNSTRNQ9Y448 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms