Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms