Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms