Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1Q9UPW5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms