Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms