Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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