Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHIC2Q9UKJ5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms