Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms