Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEFF2Q9UIK5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEFF2Q9UIK5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms