Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNNA3Q9UI47 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms