Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms