Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APEX2Q9UBZ4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms