Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DKK2Q9UBU2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms