Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK3Q9UBP4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms