Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMD4AQ9P2Q2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms