Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CC2D2AQ9P2K1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CC2D2AQ9P2K1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms