Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN3Q9P1Z3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms