Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms