Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL28Q9NXS3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL28Q9NXS3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms