Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GIN1Q9NXP7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIN1Q9NXP7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms