Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LTBP3Q9NS15 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
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