Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELLSQ9NRZ9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms