Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP35Q9NRY4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGAP35Q9NRY4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms