Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUOX2Q9NRD8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUOX2Q9NRD8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DUOX2Q9NRD8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUOX2Q9NRD8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUOX2Q9NRD8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUOX2Q9NRD8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DUOX2Q9NRD8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms