Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC31BQ9NQW1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31BQ9NQW1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms