Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYLDQ9NQC7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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