Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPCPD1Q9NPB8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms