Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC52A2Q9HAB3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms