Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms