Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BCO2Q9BYV7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms