Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms