Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC106Q9BWC9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC106Q9BWC9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms