Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms