Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf16Q9BUW7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms